Nie wiem czy dobrze zrozumiałeś, każdy układ/moduł na osobnej płytce. Np: lcd osobno, Atmega8 osobno, microswitch'e osobno, Attiny na osobnej i tak dalej. Oczywiście nie dzieląc tego przesadnie, tranzystory z rezystorami do sterowania wyświetlaczami LED oczywiście na jednym segmencie (pamiętaj aby na każdej płytce dać elektrolit i 100nF, bo zakłócenia powstałe w kablach łączących przeszkodzą Ci w ćwiczeniach).
Teraz chyba lepiej wytłumaczyłem.
PS: Ja osobiście polecam płytkę stykową, bardzo wygodne, w każdej chwili możesz zmodyfikować wszystko. Nie używasz przy tym lutownicy.