Zobacz na temat o łączeniu diod LED. Możesz przyjąć, że twoja bateria to dioda (ale taka trochę inna) i też musisz zastosować opornik. Inna bo zmnienia się na niej napięcie w trakcie ładowania i te zmiany będą powodować zmianę prądu.
Obciążalność portu USB wynosi 500mA. Można przyjąć, że zdaży ci się podłączać totalnie padnięte akumulatorki (po ok 1V na ogniwie). To jest najbardziej skrajny przypadek poboru prądu i jego trzeba rozważać przy obliczeniach.
Akumulatorki podłączasz szeregowo, czyli "spadek" na nich wynosi 2V, zasilanie 5V, na oporniku zostaje 3V
Aby mieć margines bezpieczeństwa, przyjąłem prąd 490mA, co po przeliczeniu (R = 3V / 0.490A) daje opornik 6,12 Ohm. Oczywiście takiego nie ma i trzeba przyjąć jakiś większy, albo sprawdzić co się stanie na 6Ohm (o ile taki jest).
Z drugiej strony mamy całkowicie naładowane akumulatorki. Czyli po ok 1.45V na ogniwo, razem 2,9V.
Czyli pod koniec ładowania będzie płynął prąd I = (5V - 2,9V) / 6.12 Ohm = 0,343 A
Opornik powinien być co najmniej 2W, a żeby się mniej grzał to lepiej 5W.
Oczywiście można się pokusić o stabilizator prądu i wtedy będzie zawsze płynął taki sam prąd. Ale czy warto.