Naciśnij na strzałkę przy przycisku "Buduj" (ikona z młotkiem) i wybierz "Release". Eclipse domyślnie ustawia cel budowania "Debug", a wtyczka do AVR domyślnie przekazuje do avrdude ścieżkę dla celu "Release", a każdy cel ma osobny folder w folderze projektu. Pewnie można to przestawić, ale ja po prostu tworzę projekty tylko z celem "Release" i mam spokój.
EDIT:
Chwila, nie przyjrzałem się dokładnie. Możesz sprawdzić to, co napisałem, a jak nie, to spróbuj zbudować projekt jeszcze raz i upewnij się, że nie ma błędów, bo na tym zrzucie je masz, zajrzyj do zakładki "Problems" na dole.