Trochę się pospieszyłeś z tym projektem płytki bo na schemacie aż roi się od błędów.
Głównie to dziwne podłączenie potencjometrów. A w sumie rezystorów regulowanych. Ale przecież na 99.99% mają one możliwość podłączenia jak potencjometry (bo na 99.99% są potencjometrami

) to po prostu wypadało by je tak podłączyć. Do tego przydały by się kondensatory do linii ADC do masy.
Rezystorów podciągających przyciski nie musowo dawać, ale można. Zależy czy te przyciski będą na płytce czy podłączane przewodami z skądś dalej.
Co do rezystora i diody LED to tak jak wyżej. Tyle że to pewnie nie wymaga zmian na PCB bo każdy rezystor wygląda tak samo, a dioda jest prawie symetryczna a więc to żaden problem wlutować ją odwrotnie.
Do tego, też jak wyżej, AREF kondensatorem 100nF do masy.
Więcej kondensatorów filtrujących zasilanie.
No i przydał by się kwarc jak chcesz to komunikować po RSie.
Zaraz Ci wyskoczy kilka osób że nie musowo bo oni kwarca nie stosują a im działa.
Ale co jak nie zadziała?
Zawsze lepiej mieć miejsce na PCB na kwarca. Nie musowo go przecież montować. A jak by nie zadziałało to się go po prostu bez problemowo zamontuje (bo będzie na niego miejsce) i po problemie.