Teoretycznie można, ale bazę tranzystora trzeba połączyć przez rezystor ograniczający. wszystko zależy od prądu pobieranego przez silnik, czyli w sumie od mocy traconej na tranzystorze - bo na pewno będzie się grzał. Rezystor musi być tak dobrany aby na tranzystorze w stanie "zasterowanym" występowało minimalne napięcie kolektor/emiter, wtedy moc odłożona na tranzystorze będzie najmniejsza. Ale to tylko dla zabawy.
Bez najmniejszego problemu i wielkich obliczeń wystarczy dać do takiego wentylatorka na 12V najzwyklejszy tranzystor typu np BD139 i rezystor np 2,2K pomiędzy bazą tranzystora a pinem procka. Tranzystor jest do 1A, wentylatorek pobiera zwykle ok 100-200mA, Więc tranzystor nawet nie piśnie jeśli chodzi o grzanie się.