Jeśli nie masz, to na wszelki wypadek przygotuj nośnik z instalką windowsa (płytę dvd, albo pendrive).
Zgaduję, że na dysku wewnętrznym masz podmieniony MBR który wskazuje na pliki GRUBa na dysku zewnętrznym.
By powrócić do stanu początkowego. Z windowsa uruchom komendę (z uprawnieniami administratora): bootrec /FixMbr
To powinno wystarczyć, by windows zaczął uruchamiać się tak jak przed instalacją linuksa. Niestety nie będziesz mógł uruchomić GRUBa. W tym celu odpal jakiś linux liveCD, ustaw na dysku zewnętrznym aktywną partycję i następnie zainstaluj GRUBa na dysku zewnętrznym.
Wtedy przy uruchamianiu komputera wciskając klawisz F12 będziesz mógł wybrać czy chcesz uruchomić komputer z dysku z windowsem, czy z tego zewnętrznego.