Ja stosuję autorouter do jednostronnych ... z czystego lenistwa
Zworek ci sam z siebie nie wstawi.
Ale możesz to obejść projektując płytkę jako dwustronną i ustawiając mu niskie routing priority dla tej strony "bez miedzi", a wysokie dla tej "z miedzią". W ten sposób on ci sam wstawia gdzie już musi przelotki (via), a po drugiej stronie łączy je ścieżkami - przy tym minimalizuje tę druga stronę: wstawia tam tych ścieżek minimum - bo jest niższy priorytet, a resztę prowadzi po tej właściwej.
Oczywiście tych ścieżek po "drugiej stronie" nie będzie - zrobisz tu zworki kabelkami!
Ja jeszcze robię tak, że ustawiam sobie parametry dla Via (średnice) jak dla normalnych padów ... żeby się łatwiej te kabelki lutowało (standardowe Via jest za malutkie). Schemat połączeń też mam gotowy (to rysunek ścieżek na tej stronie bez miedzi) - wystarczy tylko wydrukować

Lenistwo jest motorem postępu
Edit: zapomniałem dodać że to w protelu DXP. Nie pamiętam czy w 99se też się da ustawić ten routing priority